目前还没有能够完全治愈艾滋病的药物，治疗艾滋病的药物主要是抗病毒药物，抑制HIV病毒的复制。HIV病毒一旦进入人体，很容易与人体细胞整合到一起，终身从体内难以清除。
HIV病毒进入人体之后主要是损伤人体的免疫系统，以人体免疫系统当中最重要的CD4＋T淋巴细胞为攻击目标，使人体的免疫功能丧失，造成多种机会性感染。所以应用抗病毒药物，主要是降低HIV病毒的载量，减少对人体免疫系统的攻击。目前抗病毒药物有替诺福韦、齐多夫定、恩曲他滨、依非韦伦、奈韦拉平等。