精子畸形率99%，这种情况怀孕后也没有太大的影响。只是精子畸形率99%，怀孕的可能性一般很低。只要可以正常怀孕，说明精子活力就是非常好的精子。正常情况下精子的正常形态大约4%，畸形的精子大约96%。因为很多精子在刚产生后，就会排出体外，这种情况化验畸形率比较高。如果可以怀孕就是活力非常好的精子，建议进行正常的安胎工作。在怀孕后，一定要注意合理的营养，要减少感染的风险。