肠易激综合征一般通过大便常规检查、大便隐血检查进行筛查，也建议患者进行肠镜检查，明确是否存在肠道息肉、肠道肿瘤以及炎症性肠病。
对于便秘的患者，可能是由于盆底肌肉痉挛导致，因此需要进行盆底肌的肌张力测定。此外，患者可能还需要进行腹部B超或者CT检查，排除腹腔内脏器疾病。因为肠易激综合征的发生与心理、精神因素非常密切，对于反复发作的患者，还需要进行心理疾病的评估。
肠易激综合征患者有腹痛、腹胀、腹部不适表现，同时伴有排便异常，诊断的重点在于排除其它可以解释这些症状的病理和器质性疾病。所以对于存在上述表现，同时伴有报警症状，比如年龄＞40岁以上的患者，出现大便结血、粪便隐血阳性、贫血表现，或者有腹部包块、腹水、发烧、体重减轻或者家族内存在结肠癌病史，需要去专科门诊进行一系列的检查以明确病因。
