尿道疼痛多见于泌尿系统感染性的疾病，通常还会合并尿频、尿急等尿路刺激症状，严重的可以导致尿道分泌物，以及盆腔、会阴疼痛等临床表现。
尿路感染包括上尿路感染、下尿路感染，上尿路感染通常以肾盂肾炎为多见，而下尿路感染以尿道炎、膀胱炎、前列腺炎等多见。因此对于泌尿系统的感染，通常考虑给予抗感染的治疗方案。
首先选择比较敏感的药物，如喹诺酮类、头孢类、青霉素类的药物，对于反复迁延不愈，治疗效果不好的情况，也可以采用根据药敏的结果来选用合适的抗生素治疗。可以根据疼痛的分级采用非甾体类止痛药物，或者阿片类受体的药物来进行对症止痛治疗。
其他的疾病，如泌尿系统的结石、肿瘤、异物、损伤、结核等导致的尿痛，要以治疗原发疾病为主。
