肛门镜检查是肛肠科医生一个很重要的检查手段，是通过比较稍微短的一个镜子，放到病人的肛门内，而后能在这个肛门镜下发现出血，甚至于内部是否有感染、是否有窦道的内口，包括有的人食用食物较粗糙，有时候肛门内的异物，也能通过肛门镜来发现。
现在随着医学的发展，肛门镜和电子类的仪器相结合，目前电子肛门镜，是比较先进的检查，如同电子纤维结肠镜检查一样，只不过是它能通过电脑显示屏，将里面发现的这些肛门息肉，甚至于肛乳头瘤、痔核的大小、出血的部位，都能很明确的、很直观的让病人自己也能看到，所以肛门镜检查是肛肠科医生需要掌握的一个最基本的检查方法。
还有一个就是肛门镜检查有一定的禁忌症，比如孕妇、肛门裂较严重的病人急性发作期，还有肛门脓肿疼的比较严重的情况下，如果肛门镜进入不是较顺利，为了使病人的舒适度较好，减轻病人痛苦，肛门镜不是每一个病人都可以做检查的。
