骨髓炎如果能够得到早期诊断，选择合适手术和抗生素进行治疗，可以取得良好效果。
慢性骨髓炎治疗需要多层面手段，除抗生素抑制、外科手术清创和重建外，还应考虑到患者伴随疾病，并进行恰当处理，如优化糖尿病患者血糖、戒烟和肝肾功能不全治疗。
慢性骨髓炎如不手术难以治愈，抗生素很少能彻底治疗各种原因引起的感染，根治一般需要彻底外科手术清创和无效腔处理，联合有效抗生素治疗。局部手术清创联合抗生素治疗，并辅助营养支持治疗，可减轻患者痛苦和限制窦道分泌。
治疗方法选择必须根据患者具体情况进行个体化评估，目前慢性骨髓炎治疗以大段骨切除以及伊里扎洛夫骨搬移技术为主，已经属于一次革命，彻底清创后加上骨搬移，往往可以得到彻底根治。
