如果是相同缺损直径的室间隔缺损和房间隔缺损，室间隔缺损通常为更严重。相同直径的室缺和房缺，相对而言室间隔缺损的分流量压差更大，对心脏的影响更大，通常判断室间隔缺损和房间隔缺损的严重程度要看缺损的直径。

心脏有两个心房和两个心室，其中左心房和右心房互不相通，左、右心房之间有完整的房间隔相隔。如果在胎儿出生之后，由于各种原因导致心房间隔未能及时、有效地融合，可能会遗留异常的通道，在临床中称之为房间隔缺损。房间隔缺损可能会造成左房的血液向右房分流，久病之后会引起右房增大、右心功能不全，甚至导致右心衰竭和肺动脉高压。另外两个心室之间有完整的室间隔相隔，可以防止左心室的动脉血向右心室分流。如果由于先天性因素造成室间隔未能完全融合，遗留异常的通道，通常称之为室间隔缺损。室间隔缺损可能造成左室的动脉血向右室分流，也会造成右心功能不全，甚至会形成肺动脉高压。