PET-CT可以检查出大多数癌症，部分特殊类型癌症，PET-CT很难发现，包括罕见肿瘤和惰性肿瘤，常见如下：
1、罕见肿瘤：比如神经内分泌瘤，如果分化比较好，级别比较低的G1和G2级，无法通过PET-CT发现。需要进行特殊类型的PET-CT扫描，即应用特殊造影剂进行扫描，才可发现罕见肿瘤；
2、惰性肿瘤：比如黏液性肿瘤、肾细胞癌，因为肿瘤生长速度较慢，PET-CT无法查出。因为PET-CT原理是利用肿瘤增殖和代谢旺盛特点，患者需注射药水，主要成分是葡萄糖，因为肿瘤长得很快时，会优先摄取葡萄糖，才可在PET-CT下显示不同肿块。惰性肿瘤生长不旺盛也不摄取葡萄糖，无法通过PET-CT检测。
