长时间打嗝，大多数人是由胃肠道疾病所引起，包括功能性疾病，叫功能性消化不良，其原因跟中枢神经系统功能紊乱有关，比如有的人长期存在紧张、有压力、焦虑、抑郁情绪，会影响到胃肠道功能，可能会出现动力紊乱的情况。
有些人可能是胃的动力、胃底的舒张能力下降，或者胃体收缩能力下降，也会出现胃内压力升高的情况，会出现打嗝症状。
还可能是消化的消化酶分泌少，食物不能够被充分的消化，在肠道里经过细菌作用以后，消化道里的气体产生过多，也会有一部分气体随着消化管腔进入到上消化道，进入到胃里，从胃里排出时就会产生打嗝症状。
还有些人是器质性病变，比如有胃炎、胃糜烂、胃溃疡等器质性病变，导致了胃的功能紊乱，功能障碍也会出现打嗝的情况。还有比较常见的幽门螺杆菌感染，会导致出现腹胀等不舒服的感觉，同时可能会出现打嗝，其实还影响到了胃的动力。
