复杂性尿路感染和单纯性尿路感染有区别，区别的主要点是在于其是否继发于某一种泌尿系统疾病，或者其他系统疾病，具体如下：

1、病因不同：单纯性尿路感染主要见于各种病原微生物直接感染身体，或者泌尿系统器官没有其他器质性的问题。而复杂性尿路感染主要继发于某一种机体，或者泌尿系统疾病，比如如果泌尿系统存在梗阻性病变，它会导致积水而产生感染，这种情况有复杂的病因；

2、治疗不同：由于复杂性尿路感染和单纯性尿路感染的病因不尽相同，因此在治疗的选择上也不尽相同。对于单纯性尿路感染，最主要的治疗是抗菌素治疗，可以根据尿培养的结果，选择敏感抗菌素，而根据感染的部位，选择静滴或者口服，一般用药周期都比较短。对于复杂性尿路感染，除了要进行积极有效的抗感染治疗，而且抗感染的力度通常比单纯性尿路感染力度更大，同时还要积极处理泌尿系统疾病，如引起感染的积水或者结石，要将这些原发疾病进行处理以后，才能够有效控制感染。