球囊扩张术和支架主要应用于冠心病，即冠状动脉粥样硬化性心脏病，另外还应用于颈动脉、锁骨下动脉、肾动脉，甚至股动脉等外周血管疾病，除此之外，主动脉缩窄也可通过球囊扩张加支架进行治疗。两者均属于治疗手段，也可认为是治疗手段的两个步骤。其中球囊扩张术相对较早出现，主要应用于冠心病，工作原理是当冠心病血管狭窄之后，用气球样物体把血管撑开，但撑开后会再狭窄，所以发明支架技术，即利用球囊扩张血管同时，把支架放进血管，预防再狭窄。
总体而讲，第一步先进行球囊扩张，第二步放支架，对于部分患者在放完支架后，还需要用球囊扩张。对于不适合放支架的冠心病患者，通常建议使用药物球囊，即用涂抹药物后的球囊扩张血管病变。总的来说，两者区别是支架治疗后会在体内留有支架，而球囊只是在血管内进行扩张动作，做完之后就没有留有什么物质在心脏里面。
