角膜薄，一般不建议做全飞秒手术，因为角膜薄时做全飞秒手术可能会丧失更多的角膜组织。
此时可以做准分子激光角膜上皮细胞下角膜磨镶手术，是将高浓度的酒精，比如20%的酒精浸泡角膜上皮细胞，将上皮细胞去除，因为上皮细胞1-2天可以再生修复，因此完全不用担心。然后在上皮细胞下进行准分子激光的磨镶，达到矫正近视的目的。
全飞秒手术是在角膜上皮下把角膜组织消融掉，取出来一个凸透镜，使角膜变凹，变成一个凹透镜，像眼镜一样，达到矫正近视的目的。
全飞秒手术要比准分子激光角膜上皮细胞下角膜磨镶手术，消蚀掉的角膜组织多。因此在角膜薄时不建议做，而可以考虑做准分子激光角膜上皮细胞下角膜磨镶手术。
但如果角膜太薄时，不能预留到450微米，仍然不建议做任何一种类型的准分子激光角膜手术。对于高度近视、角膜薄的病人，推荐做SL手术来矫正高度近视。
