一旦诊断为血栓，无论动脉血栓还是静脉血栓，均无法通过食物、水果溶解血栓，而是需要规范治疗。最基本的药物是抗凝药物，比如低分子肝素需皮下注射，口服药物主要是维生素K拮抗剂，如华法林，或新型口服抗凝药，如利伐沙班。
若为多量血栓或者血栓位置较多，比如中央性、前置性静脉血栓，通常抗凝达不到效果。这时需要植入下腔静脉滤器，穿刺深静脉置管溶栓或者吸栓。除血栓静脉治疗需要用药外，有时还需要吸栓、碎栓或者导栓，比如机械吸栓，通过一定仪器，比如AngioJet血栓抽吸，减少或者治疗血栓，单纯通过药物溶解血栓，可能性有但偏小。对于急性期血栓，2周内血栓有可能溶解，亚急性期、慢性期血栓，或者急性期大量血栓、中期性血栓、全身性血栓，可能单纯通过服药不能解决问题。
