矮小症诊断是将一个个体儿童身高数值与相似生活环境下，同种族、同年龄、同性别正常儿童身高参照值做比较。如果低于参照人群平均身高数值减去两个标准差，或低于第三百分位数，就是所说矮小症。如果一个3周岁整男孩，目前量身高是89cm，判断是否属于矮小症，需要对照我国目前采用男孩0-18岁儿童青少年身高体重百分位数值表，此数值表基于2005年九省市儿童体格发育调查数据所制定参照数值。由数值表可对比3周岁男孩身高，第三百分位数数值对应应该是89.7cm，目前男孩身高是89cm，小于参照人群数值第三百分位数，所以男孩符合矮小症诊断。
如果一个4岁半女孩，目前身高测量是99cm，从女孩百分位数值表上，可对比4岁半女孩身高第三百分位数数值对应是99.2cm，因此女孩身高小于参照人群数值第三百分位数，属于矮小症。所以不同性别，不同年龄儿童身高是否符合矮小症诊断，一定要对照数值表中相应参照数值才能来确定。