舌尖起两个小疱疱好疼，可能是上火、烫伤、口腔神经功能紊乱导致，也可能是口腔溃疡、口腔疱疹、舌乳头炎等导致，需根据具体病因选择合适的治疗方法。

1、上火：如果近期工作精神压力过大，长期熬夜或食用辛辣刺激性食物导致上火，可表现为舌尖起小水疱伴有疼痛感，针对该情况可以通过听音乐、练瑜伽等方式释放压力，保持饮食清淡，多进食绿豆汤、莲子汤、菊花茶、薄荷茶，以及火龙果、西瓜、柚子等具有降火作用的食物，同时注意早睡早起；

2、烫伤：如果食用过烫的食物导致舌头黏膜被烫伤，则可导致舌尖起疱、疼痛，疼痛严重者可以遵医嘱使用林可霉素利多卡因凝胶等治疗，还可以用曲安缩松-尿素软膏治疗；

3、口腔神经功能紊乱：如果缺乏维生素B、维生素C以及锌等营养元素，导致口腔内神经功能紊乱，也可能损害口腔黏膜健康，从而出现舌尖起小疱、疼的症状，可以遵医嘱口服复合维生素B片或者谷维素片、维生素C片等药物治疗；

4、口腔溃疡：如果舌尖上长口腔溃疡，多有疼痛感，部分人也会将溃疡误认为是小水疱，明确病情后可以在医生指导下外用复方氯己定含漱液、康复新液等药物治疗；

5、口腔疱疹：主要由单纯疱疹病毒感染所致，典型表现为口腔黏膜充血水肿，有口腔疱疹、发热、乏力等症状，建议及时进行抗病毒治疗，如在医生指导下应用甲硝唑片、利巴韦林片等药物；

6、舌乳头炎：指舌乳头因口腔局部刺激、生活习惯不良、营养不良等因素出现充血、红肿、疼痛等症状，治疗上可以给予复方板蓝根口服液、板蓝根颗粒、甲硝唑片等药物治疗。

除此之外，患有变应性口炎等疾病时也可以引起口腔黏膜炎症性疾病，出现上述症状，建议患者及时到口腔科就医检查，明确病因后进行针对性治疗。