内膜异位手术在临床上指的是子宫内膜异位症的手术，为妇科手术，可以切除病灶，恢复正常的结构。
子宫内膜异位症是指子宫内膜组织生长在子宫腔与子宫肌层以外的部位，异位的内膜可以侵犯全身任何部位，但是大多数位于盆腔脏器和壁腹膜，主要表现为痛经、月经异常、不孕等。子宫内膜异位症的治疗目标是减小和去除病灶，减轻和控制疼痛，治疗和促进生育，医生会根据患者的具体情况采取相应的措施。
有生育要求的轻度患者，在明确诊断后可以先行药物治疗，病情重者行保留生育功能手术。年轻没有生育要求的重症患者可以行保留卵巢功能手术，并辅以药物治疗。症状及病变均严重、且无生育要求的患者，可行子宫和双附件切除以及病灶清除手术。
手术有经腹和腹腔镜两种途径，腹腔镜创伤小、恢复快，术后较少出现粘连，是最佳的处理方式，目前临床上腹腔镜确诊、手术以及药物治疗为金标准治疗。
