急性血源性骨髓炎要与蜂窝组织炎、骨癌、骨梗死、戈谢病相鉴别。
1、蜂窝组织炎：蜂窝组织炎是由于皮肤严重感染所导致的皮肤炎症病变，患者会伴随有类似骨性疼痛的迹象。但是通过医学影像检查检查，炎症尚未累及骨骼，从而对其与急性血源性骨髓炎进行鉴别。
2、骨癌：骨癌是发生于骨骼组织的恶性癌变，患处也会伴随有明显骨痛、皮肤改变等体征，但是通过X光、CT等医学影像检查，可观察到骨骼浸润性破坏的迹象，并可以与急性骨科炎症疾病进行区分。
3、骨梗死：骨梗塞与急性血源性骨髓炎也多发生于胫骨、肱骨等部位。但是骨梗阻常以对称性病变形式发生，并且通过骨密度测定、CT等检查方式即可进行简单鉴别。
4、戈谢病：某些戈谢病患者也会出现有病理性骨折的迹象。但是由于戈谢病是属于代谢系统疾病，所以通过检测血液中葡糖脑苷脂酶的含量水平，即可进行快速诊断。
