巨细胞病毒IgM抗体偏高，需要进一步查血清中巨细胞病毒DNA。如果DNA阳性，才需要抗病毒治疗。
对于巨细胞病毒感染的抗病毒治疗，首选药物是更昔洛韦。一般首选静脉注射更昔洛韦进行抗病毒治疗，口服的更昔洛韦生物利用度不高，效果比较差。感染巨细胞病毒后，有些患者不应用更昔洛韦也可以得到自愈。有些患者病程长，需要应用更昔洛韦进行治疗。
对于免疫功能低下的人群，巨细胞病毒再次被激活引起的感染通常疗程比较长，因为患者本身免疫功能低下，病情容易加重。