在胚胎时期，口腔颌面部的发育是在胚胎发育的3周开始，在胚胎发育到第8周时，胎儿的面部已经初步完成，形成了腭部。所以胚胎发育到第12周左右，胎儿颜面部已经发育完全。因此，唇腭裂一般是在怀孕12周之前形成的。在受精卵着床以后到12周之前，属于胚胎容易导致畸形的敏感期。任何有害因素或者干扰胚胎发育的不良环境，都有可能造成胚胎发育异常。唇腭裂的发生因素有环境因素、自身因素以及内分泌的因素。凡是能够造成胚胎的球状突和上颚的融合出现障碍，就会表现为唇裂或者唇腭裂。