男性性功能障碍最常见的是勃起功能障碍和早泄，这两种病检查的方法和项目不完全一样，勃起功能障碍要检查以下的项目：
1、病史的详细询问；
2、体格检查，包括第二性征发育、生殖系统检查、外周血管检查、神经系统检查；
3、实验室检查，包括血糖、尿糖、血脂、生殖激素、甲状腺激素这些检查；
4、特殊检查，包括夜间阴茎胀大试验、视听觉性刺激反应测定、阴茎的血流检测、勃起神经检测、阴茎海绵体活体组织检测等等。
早泄的检查除了详细的病史询问以外，要进行早泄患者性功能评估表的评分。还要进行神经系统的检查，主要是阴茎背神经感觉诱发电位检查和阴茎头感觉诱发电位检查。早泄也有一些内分泌方面的检查，比如卵泡刺激素、黄体素、催乳素、睾酮、雌二醇等测定。