免疫抑制治疗是目前肾病综合征最主要的治疗手段，常用的药物有三类：
1、糖皮质激素，包括泼尼松、泼尼松龙、甲泼尼龙等。
2、细胞毒类药物，如环磷酰、苯丁酸氮芥等。
3、免疫抑制药物，如吗替麦考酚酯、硫唑嘌呤、环孢素、他克莫司、来氟米特等。
目前比较新的还有生物制剂，如抗CD20单抗。治疗用药的选择、组合、剂量以及疗程均应根据肾病综合征具体的病理类型，临床表现等因素来综合决定患者的治疗。
糖皮质激素是治疗肾病综合征的主要药物，它通过抗炎、抑制免疫反应来发挥降低蛋白尿的效果。使用糖皮质激素时一定要起始量充足，减量缓慢，长期维持，避免在减量的过程中出现肾病综合征的复发。