川崎病的恢复期如果每天偶尔咳嗽，轻咳、无痰且每天咳嗽不超过10声可以不用口服药物，要多喝水，不吃甜、辣、刺激性食物。
如果咳嗽有痰、剧烈且影响休息，可以吃化痰的药，如氨溴索口服液、肺力咳合剂等，伴随发热、咳黄痰可加用抗生素，如阿莫西林、红霉素等。
如果咳嗽时间较长，持续0.5-1个月或更久，为过敏体质的人，既往有过敏的食物，伴有流清涕、打喷嚏，夜间晨起咳嗽重可吃些抗过敏的药物，如氯雷他定或扑尔敏等，同时注意避免接触过敏原，严重的可应用雾化药物，如硫酸特布他林雾化液、吸入用布地奈德混悬液、吸入用复方异丙托溴铵溶液等。