颅骨修补手术的患者如果是老年患者，有明显心肺功能损伤或严重心肺功能不全，无法耐受手术或在手术过程中可能会诱发严重的心肺功能损伤，则不适合实施手术治疗。另外在患者颅骨缺损的部位，创口有明显的感染或感染刚刚愈合不久也不适合实施手术治疗。如果缺损部位形成广泛的瘢痕组织或者局部头皮血液供应不良也不适合实施手术治疗，患者目前有明确的颅高压症状以及出现严重的精神症状，如精神失常，这类患者通常都不适合实施颅骨修补手术。