到目前为止在临床上对于生化妊娠的病因还不十分清楚，跟母亲的身体健康有一定的关系，跟胚胎的本身质量也有一定的关系，如果子宫内膜相对比较薄或者过厚，都会影响受精卵着床。另外，如果子宫内膜的容受性相对比较差，也会造成生化妊娠的可能性。　　还有免疫方面的问题，比如在临床上母体要能够接受妊娠的过程，存在比较强的免疫过程，一旦产生排斥性的反应在临床上也就是造成了生化妊娠，所以在临床上出现生化妊娠，跟母亲本身的问题有密切的关系，跟胚胎的质量也有关系。