如果小儿呼吸衰竭，是Ⅰ型呼吸衰竭时，可以给予吸氧，使用无创呼吸机。如果小儿呼吸衰竭是Ⅱ型呼吸衰竭时，首选无创呼吸机，无创呼吸机无效的情况下，可以考虑有创呼吸机的治疗。
要根据病因进行治疗，例如患者是由于重症肺炎而出现呼吸衰竭时，需要进行积极的抗感染治疗。
如果患者是由于支气管哮喘而出现呼吸衰竭时，需要使用支气管舒张剂，以及静脉糖皮质激素，例思力华、信必可、舒利迭，常用的静脉激素包括甲泼尼龙、地塞米松等。
同时有离子紊乱者，需要予以纠正，有液体量不足者，需要积极的补液。