亚急性甲状腺的甲减时期维持1-2个月左右，每个人的情况不一样，病情比较重的患者，甲减时期的持续时间更长。但是无论持续多长时间，亚急性甲状腺炎导致的甲状腺功能减退，患者的甲状腺功能最终都会逐渐恢复到正常水平，不用口服优甲乐替代治疗。但是临床上也见到部分亚急性甲状腺的患者，最后发展成为永久性的甲状腺功能减退。这部分患者同时合并血中的甲状腺球蛋白抗体，或者甲状腺过氧化酶抗体水平升高，实际上是桥本氏甲状腺炎合并亚急性甲状腺炎。