不孕症的鉴别需要到医院做一系列检查，帮助查找不孕症的原因，比如输卵管性不孕，需要做子宫输卵管造影，看输卵管的通畅度，以诊断输卵管阻塞、输卵管积水等输卵管性不孕，像多囊卵巢综合征，还有高泌乳素血症等内分泌因素，需要做血激素水平测定，看泌乳素水平，还有雄激素是否升高，同时需要做排卵监测，监测有无正常排卵，还有排卵障碍性不孕，需要做B超下排卵监测，以确定排卵是否正常，是否有小卵泡排卵、不排卵等异常。
子宫内膜异位症性不孕的诊断相对会比较困难，因为像比如痛经，还有CA125升高，并不是特异性的表现，它的确诊方法只能通过腹腔镜才能够确诊。像男性不孕因素的诊断相对就比较简单些，常用的精液常规就可以帮助诊断少精症、弱精症，还有畸形精子症这些问题，女方在B超检测排卵过程中，也可以发现一些子宫因素不孕症，比如内膜息肉、黏膜下肌瘤等情况。