引起新生儿呕吐的咖啡色液体，主要是由以下两种情况引起的：一是由咽下综合征引起的。当新生儿出生时，母亲的血液会被吸入产道，这可能会导致像咖啡一样的液体呕吐。第二种是由于新生儿出血症引起的。如果严重缺乏维生素K，就会导致凝血障碍。这时，出血的症状会出现在身体的各个部位。如果出血主要发生在消化道，可导致新生儿呕吐出咖啡色液体。