强直性脊柱炎的发病原因，最常见的有两种：
1、由于遗传因素导致的，也就是从上一代遗传获得的疾病，且20-30岁之间的男性是高发期，40岁以上及8岁以下的儿童很少发病。
如果个人是HLA-B27阳性，则应特别警惕该病的发生，特别当有腰背部疼痛，尤其是早晨起床后有僵硬感，活动后减轻或腰部活动不灵活等症状，应及时就医，以求早诊断、早治疗，防止发生脊柱强直，出现活动障碍和畸形。
2、比较常见的原因是某种微生物感染导致的，这种情况是由免疫系统失衡或者内分泌、代谢紊乱，引发微生物感染，导致强直性脊柱炎。风寒、潮湿、长期的姿势不当，都可以成为诱因。