对于膜增生性肾小球肾炎的治疗方案，目前没有特效的方法，也缺乏大规模的循证医学的研究证据。目前从为数不多的病案来看，糖皮质激素和细胞毒性药物有明确疗效的治疗方法，某些特殊情况下，雷公藤这种中药可能也有一定的作用，如果出现了相应的免疫复合物的沉积，可能血浆置换也有一定的疗效。除此之外，抗血小板和抗凝治疗也是膜增生性肾小球肾炎治疗的必需手段，但是对于抗凝是否采取华法林还是拜瑞妥，这几个药物优劣目前尚无明确的定论。总之，膜增生性肾小球肾炎的预后比较差，大多数病人会进入尿毒症阶段。