肛窦炎易导致肛腺炎症以及形成肛周脓肿，需要及时的治疗。治疗方法主要是保守治疗：1、及时口服抗生素药物治疗，可以先选用对革兰阴性杆菌有效的抗生素，比如头孢菌素类药物，抗生素药物尽量足量、足疗程正规使用。2、温水坐浴可以每天两次，每次20分钟，用温水或者带有稀高锰酸钾溶液的温水，一定要注意稀高锰酸钾溶液的浓度。3、局部物理治疗可以局部用微波、红外线等照射，有助于局部组织修复以及炎性物质的治疗。4、一定要注意养成良好的排便习惯，保持大便通畅，必要时口服芦荟胶囊通便或者使用开塞露纳肛，平时避免长时间久坐，不要吃辛辣刺激的食物，养成良好的生活作息习惯，多运动锻炼身体，提高抵抗力。