一岁三个月宝宝消化不良可以在医生指导下服用益生菌来治疗，益生菌对于调理肠胃动力等方面是有较大作用的。父母也可以给患儿服用一些具有助消化作用的药物治疗，比如胃蛋白酶等。对于消化不良比较轻的患儿，父母可以通过饮食调理改善，比如让孩子吃蒸苹果，可以起到帮助消化的作用。也可以尝试给孩子做腹部的按摩帮助胃肠消化。