系统性红斑狼疮的患者可以怀孕。但是前提是要病情缓解半年以上，并且没有中枢神经系统，肾脏或其它器官的严重损害，口服强的松的剂量要低于每天10mg以下，通常能安全的妊娠，并且能够分娩出正常的小孩。
非缓解期的系统性红斑狼疮的患者容易出现流产、早产和死胎，并且发生率在30%左右，所以需要严格的避孕。
妊娠前3个月至妊娠期，应用大多数的免疫抑制剂都有可能会影响胎儿的生长发育，所以必须要所有的免疫抑制剂停用半年以上才能怀孕。但是目前认为羟氯喹和硫唑嘌呤对妊娠影响相对较少，特别是羟氯喹可以全程使用。