疱疹性咽峡炎一般多见于儿童，传染性比较强，应该注意隔离治疗，注意消毒患儿使用过的餐具、玩具等，防止交叉感染。
注意口腔卫生，保持口腔清洁，可以用淡盐水漱口、漱喉咙。用10%的硝酸银涂在口腔黏膜的溃疡处，或者用双料喉风散、冰硼散等喷洒在咽喉部，减轻咽痛的症状。
适当服用维生素C和b等。当体温超过38.5℃时，可以给予布洛芬或者对乙酰氨基酚退热。抗病毒可以使用利巴韦林、阿昔洛韦以及中成药，如鱼腥草糖浆、蓝芩口服液等。