根据患者的个人体质以及治疗方式的不同，部分乙肝小三阳患者可以治愈或者转为携带者。对于乙肝小三阳患者，此类患者应该及时复查乙肝DNA病毒，看病毒有无复制，而且应该查肝功能，看谷丙、谷草转氨酶有无升高，如果患者病毒复制，且肝功能正常，可以暂时观察，每3月或半年复查乙肝DNA以及肝功能。
如果患者有病毒复制，且肝功能有损害，如转氨酶升高，此时患者应考虑注射干扰素治疗。经过干扰素积极治疗半年或者1年以后，有部分患者可以转为阴性，即转为病毒携带者。如果患者经济情况一般，可以考虑口服抗病毒类药物，如拉米夫定、阿德福韦酯等。
药物一经服药，大多需要终身服药，如果中途停止服药，一般会出现戒断状态，如转氨酶升高、出现腹腔积液等。