绝大多数情况下是子宫颈的生理性变化，子宫颈转化区内鳞状上皮取代柱状上皮过程中，新生的鳞状上皮覆盖子宫颈腺管口或深入腺管，将腺管口堵塞，导致腺体分泌物引流受阻，腺体潴留形成囊肿，即子宫颈纳氏囊肿。子宫颈局部损伤或子宫颈慢性炎症，使腺管口狭窄，也可导致子宫颈纳氏囊肿的形成。对于子宫颈纳氏囊肿，一般情况下属于正常的生理现象，不需要特殊治疗，但是需要进一步检查宫颈癌筛查，TCT、HPV，如果两项检查没有问题，不用治疗。