角膜炎治疗的基本原则是控制感染、减轻炎症反应、促进溃疡愈合、减少疤痕形成，药物治疗就病因用敏感抗生素。
对于细菌性角膜炎可以选用头孢类抗生素或喹诺酮类抗生素，如左氧氟沙星、氧氟沙星。对真菌性角膜炎，可以用抗真菌药物，比如氟康唑、伊曲康唑。对病毒性角膜炎，使用抗病毒药物，如阿昔洛韦、更昔洛韦眼用凝胶、联合干扰素以提高疗效。另一类药物是糖皮质激素，但一般在细菌性角膜炎急性期和真菌性角膜炎是禁用的。如果药物治疗无效，角膜溃疡穿孔或将要穿孔，可以进行角膜移植手术。