子宫内膜异位症最常异位的病变的部位就是卵巢，如果卵巢出现的病灶通常称之为巧克力囊肿，因为异位的子宫内膜病灶会随着月经周期中雌孕激素的变化而出现周期性的出血，逐渐在卵巢上形成囊肿，并且囊内液往往为咖啡样、巧克力样的物质，所以一般我们称之为卵巢巧克力样囊肿。
存在巧囊一般需要通过女性的症状、妇科内诊、超声等检查明确诊断，如果明确诊断为巧囊，如果囊肿的直径＞4cm，还是建议积极的手术治疗，并且在术后配合药物治疗来预防复发。