亚急性心内膜炎关键就是要进行积极的抗感染治疗，一般情况下要根据血培养的结果选择敏感的抗生素，要注意足疗程用药，力求彻底治愈，一般情况下需要用药4-6周。如果血培养反复阴性，可以凭借经验，针对金黄色葡萄球菌以及肠球菌的敏感抗生素，可以选择大剂量的青霉素以及氨基糖甙类的抗生素，同时需要做血培养，除外真菌、支原体感染，如果上述抗生素无效，建议选择万古霉素或者头孢菌素。如果瓣膜穿孔、破裂，腱索断裂，人工瓣膜置换术后发生感染，并发细菌性的动脉瘤破裂，有可能需要手术治疗。