肥厚型梗阻性心肌病的治疗分为一般治疗、药物治疗以及手术治疗。所谓的一般治疗主要就是注意适当的休息，劳逸结合，避免劳累，避免过度的紧张。另外，饮食方面注意清淡饮食为主，多补充维生素成分，避免暴饮暴食，戒烟戒酒，养成良好的生活习惯，平时保持好心情。药物方面主要是减轻心肌收缩力，纠正心衰，控制心律失常，常用的药物多有β受体阻断剂、螺内酯、曲美他嗪等药物。对于肥厚型梗阻性心肌病的治疗关键就是手术治疗，可以选择介入微创的方法，主要就是采用无水酒精消融手术，造成局部心肌坏死，减轻梗阻。还可以外科经过主动脉切口，进行心室间隔的心肌切除。