除器质性疾病原因外，大多数精神疾病都能够导致认知功能方面的障碍，所以认知功能障碍要针对病因治疗。如果是精神疾病导致的认知功能障碍，比如精神分裂症，那就需要相应的抗精神病药物治疗(比如利培酮，喹硫平，奥氮平，阿立哌唑等)，如果是抑郁症导致的认知功能障碍，那就需要使用抗抑郁药（舍曲林，帕罗西汀，西酞普兰，艾斯西酞普兰等），强迫症也会有认知功能的障碍，也需要使用抗抑郁药治疗（帕罗西汀，艾斯西酞普兰等），剂量需要加大，无论是什么哪种精神疾病导致的认知功能障碍，在药物治疗的基础上辅以心理治疗能够取得更好的效果。