反复发作性偏头痛可能会引发半身不遂，半身不遂在中医学称之为中风或卒中，它包括脑血栓形成、脑出血等疾病。偏头痛和脑血栓形成一般没有因果关系，但反复发作偏头痛也偶然发生脑血栓形成，有人统计，15%到30%的卒中患者可有偏头痛病史，在服用避孕药的患者中可发现偏头痛症状加重，因而脑血栓形成机会增加，因此应积极加以预防，避免脑血栓形成。另外偏瘫型偏头痛在发作时或发作后出现偏瘫，偏瘫于头痛发作终止后尚可持续一定时间后消失，甚至留有部分后遗症。