蛛网膜囊肿手术是神经外科一类常规性的手术，手术安全性比较高，术后发生严重后遗症和并发症的可能性是相对比较小的。但是，有一部分患者在处理蛛网膜囊肿术后：第一、短时间内可以出现比较剧烈的头痛、高热，甚至抽搐、昏迷等。第二、是对于比较巨大的蛛网膜囊肿，术后可能会出现囊肿内出血或硬膜下血肿。第三、是某些患者还会出现急性脑肿胀。这些主要是因为蛛网膜囊肿巨大，形成一个张力性的囊肿，在囊肿去除之后，短时间内颅内压迅速变化所致。当然，还有蛛网膜粘连的可能。