甲状腺疾病最基本的检查是甲状腺彩超、甲状腺功能（包括甲状腺激素、促甲状腺激素）、甲状腺自身抗体；另外甲亢患者和甲减患者还要查心脏彩超和心电图以了解患者心脏大小、心累快慢和心律是否整齐、有没有心包积液；对无法判断甲状腺毒症（甲状腺激素升高、促甲状腺激素降低）是甲亢引起还是由甲状腺炎引起的破坏性甲状腺毒症的患者，还要行甲状腺碘131摄取率检查以鉴别；抗甲亢药物治疗前要查血常规、肝肾功能和血糖，碘131治疗甲亢前还要查甲状腺ECT。