沙眼衣原体感染可引起沙眼、包涵体结膜炎、泌尿生殖系统感染、性病淋巴肉芽肿等多种传染性疾病。沙眼衣原体感染引起的沙眼，可局部滴利福平、磺胺醋酰钠等滴眼液，急性期或严重沙眼应全身应用抗菌素治疗，可口服多西环素，婴幼儿可口服红霉素。沙眼衣原体引起的泌尿生殖系统感染可口服阿奇霉素，连续治疗一周，也可用其他四环素或大环内酯类药物治疗。沙眼衣原体引起的性病淋巴肉芽肿，可用多西环素或米诺环素，也可采用四环素或红霉素，可根据病情适当延长治疗时间，必要时采取手术治疗。沙眼衣原体的预防是注意个人卫生，高危人群可口服红霉素或阿莫西林进行预防服药。