奥美拉唑不是抗生素，属于抑制胃酸分泌药，可以浓集于酸性环境中。口服以后可以特异性的分布于胃黏膜壁细胞的分泌小管中，通过二硫键，与细胞壁分泌膜中的质子泵的巯基，形成不可逆的结合，从而抑制酶活性，为阻断胃酸分泌的最后步骤。因此，此药对于各种原因引起的胃酸分泌，具有强而持久的抑制作用，临床常用于治疗胃溃疡、十二指肠溃疡、应激性溃疡、反流性食管炎等。奥美拉唑没有抗菌的作用，不过可以跟抗生素联合使用，杀灭幽门螺杆菌。
奥美拉唑长期使用会引起内分泌系统的改变，如患者长期服用奥美拉唑，可能会引起维生素B12的缺乏。另外，此药对肝、肾也有一定的毒性，长期使用需要定期监测肝肾功能，并定期检查胃黏膜有没有肿瘤样增生。用药超过三年者，还要监测血清维生素B12的水平。为防止抑酸过度，在治疗一般性消化溃疡时，不建议长期且大量使用。此药属于处方药，必须在医生的指导下合理使用，请遵医嘱用药。