棘球蚴病的病因是误食棘球绦虫虫卵，因此可从以下方面进行预防。
1、加强流行区牲畜管理：牛为预防人体包虫感染的关键性一环，在包虫流行区野犬应一律灭绝，家犬严加限制，对必用的牧羊犬、猎犬或警犬等必须挂牌登记。定期驱绦虫和药物监测应列为常规制度，据新西兰报告，重度流行区规定每隔6周投药驱绦一次，轻度流行区改为3个月投药一次。
2、严格肉食卫生检查：肉联厂或屠宰场要认真执行肉食的卫生检疫，病畜肝、肺等脏器感染包虫，必须妥善进行无活化处理，采用集中焚烧、挖坑深埋、药液毒等法，切忌喂狗。
3、大力开展卫生宣教：宣教方式可多样化，内容要简单通俗易懂、讲求实效。并要充分发动群众，做到家喻户晓，人人皆知。