原发性尿道癌是起源于尿道被覆上皮及腺体的恶性肿瘤，男性尿道癌较少见，常发生在50岁以后，多数起源于尿道球部和膜部，约占全部尿道癌的60%，然后是尿道阴茎部和尿道前列腺部。
有1/3的患者伴有尿道狭窄，另有1/3的患者有尿道慢性炎症的病史，因此尿道的慢性炎症刺激可能是本病的诱因之一。尿道癌最常见的组织学类型为鳞状细胞癌，然后为尿路上皮癌、腺癌和未分化癌等。
鳞状细胞癌约占全部尿道癌的80%，常发生于尿道球部和膜部。尿路上皮癌约占15%，发生于尿道前列腺部和前尿道，常与膀胱尿路上皮癌同时发生。腺癌比较少见，来源自尿道周围腺体和胚胎残留组织。