沙眼的急性期或病情严重者应全身应用抗生素，可以选用阿奇霉素、红霉素、螺旋霉素、强力霉素口服。局部治疗，可选用0.1%的利福平滴眼液，10%磺胺醋酰钠滴眼液以及左氧氟沙星滴眼液等滴眼，红霉素眼膏涂眼，疗程大概10-12周。并发症的治疗，主要是针对沙眼后遗症及并发症进行手术治疗，比如睑内翻和倒睫、睑球粘连、慢性泪囊炎等都需要进行手术矫正治疗。