胸腺瘤的手术多在胸腔镜下进行，要根据术前胸腺的位置选择左胸切口或右胸切口，也有部分病人选择剑突下切口进行操作。术后常见的并发症有术后胸腔内的积气、积液；损伤胸导管可能会出现乳糜胸；术后病人咳嗽、咳痰不利，可能会出现肺部的痰液积聚、肺部感染，甚至肺不张。手术操作的切口部位会遗留瘢痕，手术操作的切口，因操作过程中摩擦肋间神经会出现相应部位的麻木、疼痛，这种症状大概半年到一年左右，会逐渐好转。